上世纪90年代初，随着太湖治理工作的深入，江苏省水利厅为加强太湖地区水利工程的管理和运用工作，报省编委批准，于1992年12月1日成立望虞河工程管理处，1993年9月23日更名为江苏省太湖地区水利工程管理处。

（1）根据省水利厅赋予管理处的职能，负责太湖地区常熟枢纽、望亭枢纽、丹金闸枢纽、常州钟楼防洪控制工程、张家港水利枢纽、江阴水利枢纽、界牌水利枢纽和奔牛水利枢纽等水利工程的运行管理及管理范围内的堤防管理、水行政管理工作；

（2）协助省水利厅做好太湖、滆湖、长荡湖3个省管湖泊和宛山塘、鹅真荡、嘉菱荡3个市际湖泊的保护、开发、利用和管理工作；

（3）负责管理范围内水事案件的查处及河道清障工作；

（4）负责望虞河河道堤防行业管理，承担太湖流域防洪排涝、引江济太等重要任务；

（5）承担省太湖联防指挥部办公室和滆湖长荡湖联席会议办公室的职责；

（6）根据省水利厅总体安排，配合做好太湖、滆湖、长荡湖、淀山湖、苏南运河、望虞河、太浦河、新沟河、新孟河的河（湖）长制相关工作。